Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5AP29375 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms