Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 ARID2-203ENST00000426776 484 ntTSL 34.91□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.035e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.25e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 26.41□□□□□ -1.385e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.465e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 220.03■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 PHF14-204ENST00000470665 1005 ntTSL 22.8□□□□□ -1.961e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 HSF2-203ENST00000465214 642 ntTSL 22.86□□□□□ -1.958e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 DPH6-204ENST00000558973 484 ntTSL 52.82□□□□□ -1.962e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 315.77■□□□□ 0.122e-18■■■■■ 29
PTBP1P26599 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 415.08■□□□□ 02e-18■■■■■ 29
PTBP1P26599 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.129e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 412.65□□□□□ -0.382e-18■■■■■ 29
PTBP1P26599 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 29
PTBP1P26599 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.082e-18■■■■■ 29
PTBP1P26599 SLAIN2-204ENST00000510595 550 ntTSL 46.32□□□□□ -1.49e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.79e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 23.93□□□□□ -1.782e-18■■■■■ 29
PTBP1P26599 RBM6-214ENST00000464013 397 ntTSL 54.93□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.417e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 23.28□□□□□ -1.881e-22■■■■■ 29
PTBP1P26599 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 22.61□□□□□ -1.991e-22■■■■■ 29
PTBP1P26599 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 CES1-206ENST00000565403 540 ntTSL 513.64□□□□□ -0.239e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-208ENST00000409863 3490 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-207ENST00000409759 3219 ntTSL 510.05□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 CES1-204ENST00000563005 1002 ntTSL 59.89□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-202ENST00000396429 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-206ENST00000409555 3088 ntTSL 58.01□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-205ENST00000409452 3344 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 OSBPL3-214ENST00000487020 554 ntTSL 34.99□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.039e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.169e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 313.75□□□□□ -0.219e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-212ENST00000496999 775 ntTSL 213.28□□□□□ -0.289e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.289e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-209ENST00000481885 516 ntTSL 312.25□□□□□ -0.459e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 AKR1A1-203ENST00000434299 840 ntTSL 210.46□□□□□ -0.739e-8■■■■■ 29
PTBP1P26599 CASP2-202ENST00000350623 1146 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.672e-10■■■■■ 29
PTBP1P26599 CASP2-206ENST00000493642 2166 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 29
PTBP1P26599 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.226e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.156e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 SPIRE1-204ENST00000440472 2109 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-12■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 ATG10-209ENST00000514253 904 ntTSL 35.62□□□□□ -1.516e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 ATG10-205ENST00000508814 413 ntTSL 32.4□□□□□ -2.036e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MADD-223ENST00000634938 658 ntTSL 57.12□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.61e-13■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 311.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MAPK8-207ENST00000395611 5844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MAPK8-209ENST00000429041 603 ntTSL 57.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 CIT-207ENST00000536325 329 ntTSL 32.88□□□□□ -1.958e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 GTDC1-210ENST00000429978 586 ntTSL 411.44□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 EPN1-206ENST00000589704 250 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 GTDC1-209ENST00000417450 601 ntTSL 43.1□□□□□ -1.912e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 GTDC1-213ENST00000467352 792 ntTSL 42.26□□□□□ -2.052e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 ENTPD1-AS1-203ENST00000427300 389 ntTSL 39.49□□□□□ -0.894e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MTG1-204ENST00000473735 2212 ntTSL 520.13■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MTG1-202ENST00000432508 953 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 28.9
PTBP1P26599 AL139383.1-201ENST00000454681 892 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 AC020687.1-201ENST00000560439 448 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.057e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 PUM3-204ENST00000490444 340 ntTSL 52.49□□□□□ -2.018e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 28.8
PTBP1P26599 PDK1-209ENST00000466437 599 ntTSL 45.68□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 212.4 ms