Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO2P25791 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO2P25791 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO2P25791 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO2P25791 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms