Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPREP23469 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPREP23469 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPREP23469 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPREP23469 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms