Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms