Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSP20132 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSP20132 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDSP20132 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDSP20132 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDSP20132 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDSP20132 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDSP20132 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSP20132 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms