Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI3P19429 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms