Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR1P18146 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR1P18146 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms