Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSP16219 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms