Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFAP15692 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms