Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL2P13500 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms