Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms