Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CGB3P0DN86 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms