Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARP1P09874 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP1P09874 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP1P09874 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP1P09874 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP1P09874 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms