Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTMAP06454 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTMAP06454 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms