Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSNP06396 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSNP06396 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSNP06396 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSNP06396 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms