Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGAP02671 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGAP02671 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGAP02671 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGAP02671 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGAP02671 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGAP02671 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGAP02671 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms