Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSO75390 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSO75390 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSO75390 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSO75390 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSO75390 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSO75390 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSO75390 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSO75390 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSO75390 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSO75390 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSO75390 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSO75390 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSO75390 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSO75390 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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