Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ABCC9O60706 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms