Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms