Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX16O60231 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX16O60231 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX16O60231 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX16O60231 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX16O60231 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX16O60231 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms