Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA3O43365 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms