Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms