Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APAF1O14727 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APAF1O14727 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APAF1O14727 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms