Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRTO14522 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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