Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPA5E9PKD4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms