Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf172C9J069 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms