Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DXG7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DXG7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DXG7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DXG7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DXG7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms