Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms