Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL1BA8MQ27 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms