Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00473A8K010 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms