Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D7A6NKC9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms