Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC69A6NI79 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms