Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms