Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC144AA2RUR9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms