Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms