Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM30B-201ENST00000611556 397 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-B-258ENST00000640615 240 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH1L1-201ENST00000273450 3179 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCH1-204ENST00000460012 6413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO2-201ENST00000327087 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-234ENST00000640138 3408 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-201ENST00000318504 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H2APS5-201ENST00000454320 369 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4269-201ENST00000578705 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087393.3-201ENST00000584971 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms