Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F4Q16254 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms