Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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