Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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RABGEF1Q9UJ41 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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