Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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