Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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