Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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