Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HOXD11P31277 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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