Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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