Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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