Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFE2L3Q9Y4A8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFE2L3Q9Y4A8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms