Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHDC2Q9Y2U9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms