Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUDCQ9Y266 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms