Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms